Protein–RNA interactions for Protein: O43164

PJA2, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-2, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PJA2O43164 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PJA2O43164 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PJA2O43164 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PJA2O43164 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PJA2O43164 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PJA2O43164 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PJA2O43164 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PJA2O43164 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PJA2O43164 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PJA2O43164 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PJA2O43164 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PJA2O43164 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PJA2O43164 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PJA2O43164 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PJA2O43164 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PJA2O43164 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PJA2O43164 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PJA2O43164 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PJA2O43164 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PJA2O43164 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PJA2O43164 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PJA2O43164 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PJA2O43164 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PJA2O43164 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PJA2O43164 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PJA2O43164 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PJA2O43164 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PJA2O43164 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PJA2O43164 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PJA2O43164 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PJA2O43164 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PJA2O43164 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PJA2O43164 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PJA2O43164 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PJA2O43164 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PJA2O43164 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PJA2O43164 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PJA2O43164 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PJA2O43164 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PJA2O43164 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PJA2O43164 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PJA2O43164 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PJA2O43164 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PJA2O43164 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PJA2O43164 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PJA2O43164 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PJA2O43164 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PJA2O43164 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PJA2O43164 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PJA2O43164 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PJA2O43164 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PJA2O43164 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PJA2O43164 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PJA2O43164 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PJA2O43164 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PJA2O43164 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PJA2O43164 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PJA2O43164 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PJA2O43164 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PJA2O43164 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PJA2O43164 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PJA2O43164 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PJA2O43164 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PJA2O43164 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PJA2O43164 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PJA2O43164 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PJA2O43164 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PJA2O43164 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PJA2O43164 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PJA2O43164 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PJA2O43164 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PJA2O43164 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PJA2O43164 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PJA2O43164 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PJA2O43164 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PJA2O43164 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PJA2O43164 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PJA2O43164 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PJA2O43164 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PJA2O43164 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PJA2O43164 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PJA2O43164 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PJA2O43164 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PJA2O43164 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PJA2O43164 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PJA2O43164 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PJA2O43164 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PJA2O43164 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PJA2O43164 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PJA2O43164 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PJA2O43164 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PJA2O43164 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PJA2O43164 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PJA2O43164 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PJA2O43164 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PJA2O43164 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PJA2O43164 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PJA2O43164 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PJA2O43164 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PJA2O43164 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms