Protein–RNA interactions for Protein: O15544

LINC01565, Protein GR6, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01565O15544 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LINC01565O15544 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LINC01565O15544 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LINC01565O15544 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LINC01565O15544 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LINC01565O15544 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LINC01565O15544 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LINC01565O15544 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LINC01565O15544 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LINC01565O15544 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LINC01565O15544 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LINC01565O15544 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LINC01565O15544 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LINC01565O15544 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LINC01565O15544 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LINC01565O15544 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
LINC01565O15544 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LINC01565O15544 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LINC01565O15544 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LINC01565O15544 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
LINC01565O15544 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
LINC01565O15544 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LINC01565O15544 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LINC01565O15544 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
LINC01565O15544 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LINC01565O15544 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LINC01565O15544 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LINC01565O15544 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
LINC01565O15544 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
LINC01565O15544 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LINC01565O15544 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LINC01565O15544 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LINC01565O15544 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LINC01565O15544 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LINC01565O15544 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LINC01565O15544 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LINC01565O15544 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LINC01565O15544 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LINC01565O15544 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LINC01565O15544 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LINC01565O15544 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LINC01565O15544 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LINC01565O15544 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LINC01565O15544 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LINC01565O15544 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LINC01565O15544 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LINC01565O15544 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LINC01565O15544 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LINC01565O15544 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LINC01565O15544 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LINC01565O15544 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LINC01565O15544 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LINC01565O15544 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LINC01565O15544 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LINC01565O15544 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LINC01565O15544 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LINC01565O15544 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LINC01565O15544 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LINC01565O15544 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LINC01565O15544 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LINC01565O15544 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LINC01565O15544 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LINC01565O15544 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LINC01565O15544 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LINC01565O15544 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LINC01565O15544 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LINC01565O15544 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LINC01565O15544 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LINC01565O15544 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LINC01565O15544 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LINC01565O15544 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LINC01565O15544 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LINC01565O15544 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LINC01565O15544 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LINC01565O15544 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
LINC01565O15544 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
LINC01565O15544 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LINC01565O15544 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LINC01565O15544 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LINC01565O15544 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LINC01565O15544 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LINC01565O15544 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LINC01565O15544 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LINC01565O15544 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LINC01565O15544 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LINC01565O15544 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LINC01565O15544 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LINC01565O15544 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LINC01565O15544 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
LINC01565O15544 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LINC01565O15544 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LINC01565O15544 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LINC01565O15544 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LINC01565O15544 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LINC01565O15544 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LINC01565O15544 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LINC01565O15544 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LINC01565O15544 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LINC01565O15544 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LINC01565O15544 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms