Protein–RNA interactions for Protein: O15446

CD3EAP, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA34, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD3EAPO15446 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CD3EAPO15446 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD3EAPO15446 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD3EAPO15446 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD3EAPO15446 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD3EAPO15446 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD3EAPO15446 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CD3EAPO15446 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CD3EAPO15446 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CD3EAPO15446 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CD3EAPO15446 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CD3EAPO15446 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CD3EAPO15446 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CD3EAPO15446 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CD3EAPO15446 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CD3EAPO15446 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CD3EAPO15446 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CD3EAPO15446 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CD3EAPO15446 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CD3EAPO15446 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CD3EAPO15446 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CD3EAPO15446 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CD3EAPO15446 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CD3EAPO15446 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CD3EAPO15446 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CD3EAPO15446 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CD3EAPO15446 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CD3EAPO15446 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CD3EAPO15446 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CD3EAPO15446 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CD3EAPO15446 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CD3EAPO15446 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CD3EAPO15446 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CD3EAPO15446 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CD3EAPO15446 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD3EAPO15446 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD3EAPO15446 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD3EAPO15446 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD3EAPO15446 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD3EAPO15446 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD3EAPO15446 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD3EAPO15446 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD3EAPO15446 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD3EAPO15446 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD3EAPO15446 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CD3EAPO15446 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CD3EAPO15446 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CD3EAPO15446 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CD3EAPO15446 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CD3EAPO15446 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CD3EAPO15446 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CD3EAPO15446 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CD3EAPO15446 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CD3EAPO15446 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD3EAPO15446 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD3EAPO15446 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD3EAPO15446 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD3EAPO15446 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD3EAPO15446 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD3EAPO15446 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD3EAPO15446 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD3EAPO15446 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD3EAPO15446 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD3EAPO15446 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD3EAPO15446 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD3EAPO15446 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD3EAPO15446 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD3EAPO15446 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD3EAPO15446 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD3EAPO15446 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD3EAPO15446 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD3EAPO15446 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD3EAPO15446 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD3EAPO15446 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD3EAPO15446 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD3EAPO15446 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD3EAPO15446 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD3EAPO15446 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD3EAPO15446 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD3EAPO15446 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD3EAPO15446 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD3EAPO15446 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD3EAPO15446 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD3EAPO15446 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD3EAPO15446 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD3EAPO15446 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD3EAPO15446 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD3EAPO15446 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD3EAPO15446 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD3EAPO15446 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD3EAPO15446 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD3EAPO15446 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD3EAPO15446 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD3EAPO15446 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD3EAPO15446 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD3EAPO15446 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD3EAPO15446 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD3EAPO15446 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD3EAPO15446 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD3EAPO15446 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms