Protein–RNA interactions for Protein: O15232

MATN3, Matrilin-3, humanhuman

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MATN3O15232 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MATN3O15232 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MATN3O15232 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MATN3O15232 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MATN3O15232 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MATN3O15232 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MATN3O15232 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MATN3O15232 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MATN3O15232 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MATN3O15232 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MATN3O15232 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MATN3O15232 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MATN3O15232 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MATN3O15232 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MATN3O15232 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MATN3O15232 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MATN3O15232 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MATN3O15232 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MATN3O15232 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MATN3O15232 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MATN3O15232 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MATN3O15232 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MATN3O15232 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MATN3O15232 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MATN3O15232 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MATN3O15232 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MATN3O15232 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MATN3O15232 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MATN3O15232 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MATN3O15232 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MATN3O15232 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MATN3O15232 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MATN3O15232 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MATN3O15232 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MATN3O15232 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MATN3O15232 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MATN3O15232 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MATN3O15232 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MATN3O15232 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MATN3O15232 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MATN3O15232 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MATN3O15232 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MATN3O15232 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MATN3O15232 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MATN3O15232 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MATN3O15232 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MATN3O15232 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MATN3O15232 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MATN3O15232 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MATN3O15232 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MATN3O15232 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MATN3O15232 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MATN3O15232 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MATN3O15232 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MATN3O15232 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MATN3O15232 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MATN3O15232 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MATN3O15232 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MATN3O15232 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MATN3O15232 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MATN3O15232 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MATN3O15232 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MATN3O15232 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MATN3O15232 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
MATN3O15232 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MATN3O15232 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MATN3O15232 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MATN3O15232 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MATN3O15232 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MATN3O15232 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MATN3O15232 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MATN3O15232 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MATN3O15232 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MATN3O15232 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MATN3O15232 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MATN3O15232 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MATN3O15232 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MATN3O15232 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MATN3O15232 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MATN3O15232 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MATN3O15232 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MATN3O15232 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MATN3O15232 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MATN3O15232 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MATN3O15232 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
MATN3O15232 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MATN3O15232 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MATN3O15232 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MATN3O15232 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MATN3O15232 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MATN3O15232 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MATN3O15232 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MATN3O15232 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MATN3O15232 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MATN3O15232 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MATN3O15232 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MATN3O15232 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
MATN3O15232 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MATN3O15232 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MATN3O15232 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms