Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ANKRD28O15084 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ANKRD28O15084 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ANKRD28O15084 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ANKRD28O15084 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ANKRD28O15084 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ANKRD28O15084 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ANKRD28O15084 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ANKRD28O15084 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ANKRD28O15084 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ANKRD28O15084 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ANKRD28O15084 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ANKRD28O15084 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ANKRD28O15084 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ANKRD28O15084 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ANKRD28O15084 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ANKRD28O15084 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ANKRD28O15084 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ANKRD28O15084 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ANKRD28O15084 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ANKRD28O15084 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ANKRD28O15084 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ANKRD28O15084 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ANKRD28O15084 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ANKRD28O15084 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ANKRD28O15084 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ANKRD28O15084 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ANKRD28O15084 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ANKRD28O15084 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ANKRD28O15084 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ANKRD28O15084 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ANKRD28O15084 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ANKRD28O15084 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ANKRD28O15084 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ANKRD28O15084 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ANKRD28O15084 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ANKRD28O15084 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ANKRD28O15084 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ANKRD28O15084 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ANKRD28O15084 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ANKRD28O15084 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ANKRD28O15084 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ANKRD28O15084 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ANKRD28O15084 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ANKRD28O15084 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ANKRD28O15084 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ANKRD28O15084 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ANKRD28O15084 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ANKRD28O15084 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ANKRD28O15084 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ANKRD28O15084 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ANKRD28O15084 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ANKRD28O15084 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ANKRD28O15084 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ANKRD28O15084 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ANKRD28O15084 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ANKRD28O15084 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ANKRD28O15084 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ANKRD28O15084 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ANKRD28O15084 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ANKRD28O15084 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ANKRD28O15084 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ANKRD28O15084 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ANKRD28O15084 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ANKRD28O15084 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ANKRD28O15084 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ANKRD28O15084 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ANKRD28O15084 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ANKRD28O15084 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ANKRD28O15084 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ANKRD28O15084 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ANKRD28O15084 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ANKRD28O15084 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ANKRD28O15084 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ANKRD28O15084 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ANKRD28O15084 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ANKRD28O15084 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ANKRD28O15084 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ANKRD28O15084 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ANKRD28O15084 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ANKRD28O15084 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ANKRD28O15084 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ANKRD28O15084 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ANKRD28O15084 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ANKRD28O15084 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ANKRD28O15084 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ANKRD28O15084 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ANKRD28O15084 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ANKRD28O15084 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ANKRD28O15084 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ANKRD28O15084 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ANKRD28O15084 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ANKRD28O15084 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ANKRD28O15084 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ANKRD28O15084 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ANKRD28O15084 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ANKRD28O15084 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ANKRD28O15084 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ANKRD28O15084 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ANKRD28O15084 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms