Protein–RNA interactions for Protein: O15041

SEMA3E, Semaphorin-3E, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3EO15041 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SEMA3EO15041 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SEMA3EO15041 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SEMA3EO15041 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SEMA3EO15041 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SEMA3EO15041 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SEMA3EO15041 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SEMA3EO15041 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SEMA3EO15041 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SEMA3EO15041 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SEMA3EO15041 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SEMA3EO15041 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SEMA3EO15041 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SEMA3EO15041 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SEMA3EO15041 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SEMA3EO15041 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SEMA3EO15041 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SEMA3EO15041 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SEMA3EO15041 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SEMA3EO15041 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SEMA3EO15041 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SEMA3EO15041 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
SEMA3EO15041 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SEMA3EO15041 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SEMA3EO15041 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SEMA3EO15041 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SEMA3EO15041 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SEMA3EO15041 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SEMA3EO15041 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SEMA3EO15041 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SEMA3EO15041 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SEMA3EO15041 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SEMA3EO15041 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SEMA3EO15041 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SEMA3EO15041 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SEMA3EO15041 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SEMA3EO15041 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SEMA3EO15041 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SEMA3EO15041 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SEMA3EO15041 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SEMA3EO15041 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SEMA3EO15041 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SEMA3EO15041 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SEMA3EO15041 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SEMA3EO15041 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SEMA3EO15041 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SEMA3EO15041 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
SEMA3EO15041 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SEMA3EO15041 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SEMA3EO15041 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SEMA3EO15041 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SEMA3EO15041 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SEMA3EO15041 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SEMA3EO15041 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SEMA3EO15041 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SEMA3EO15041 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SEMA3EO15041 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SEMA3EO15041 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SEMA3EO15041 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SEMA3EO15041 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SEMA3EO15041 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SEMA3EO15041 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SEMA3EO15041 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SEMA3EO15041 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SEMA3EO15041 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SEMA3EO15041 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SEMA3EO15041 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SEMA3EO15041 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SEMA3EO15041 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SEMA3EO15041 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SEMA3EO15041 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SEMA3EO15041 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SEMA3EO15041 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SEMA3EO15041 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SEMA3EO15041 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SEMA3EO15041 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SEMA3EO15041 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SEMA3EO15041 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SEMA3EO15041 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SEMA3EO15041 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SEMA3EO15041 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SEMA3EO15041 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SEMA3EO15041 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SEMA3EO15041 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SEMA3EO15041 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SEMA3EO15041 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SEMA3EO15041 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SEMA3EO15041 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SEMA3EO15041 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SEMA3EO15041 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SEMA3EO15041 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SEMA3EO15041 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SEMA3EO15041 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SEMA3EO15041 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SEMA3EO15041 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SEMA3EO15041 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SEMA3EO15041 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SEMA3EO15041 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SEMA3EO15041 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SEMA3EO15041 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms