Protein–RNA interactions for Protein: O00592

PODXL, Podocalyxin, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXLO00592 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PODXLO00592 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PODXLO00592 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PODXLO00592 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PODXLO00592 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PODXLO00592 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PODXLO00592 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PODXLO00592 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PODXLO00592 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PODXLO00592 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PODXLO00592 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PODXLO00592 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PODXLO00592 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PODXLO00592 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PODXLO00592 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PODXLO00592 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PODXLO00592 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PODXLO00592 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PODXLO00592 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PODXLO00592 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PODXLO00592 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PODXLO00592 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PODXLO00592 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PODXLO00592 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PODXLO00592 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PODXLO00592 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PODXLO00592 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PODXLO00592 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PODXLO00592 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PODXLO00592 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PODXLO00592 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PODXLO00592 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PODXLO00592 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PODXLO00592 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PODXLO00592 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PODXLO00592 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PODXLO00592 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PODXLO00592 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PODXLO00592 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PODXLO00592 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PODXLO00592 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PODXLO00592 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PODXLO00592 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PODXLO00592 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PODXLO00592 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PODXLO00592 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PODXLO00592 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PODXLO00592 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PODXLO00592 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PODXLO00592 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PODXLO00592 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PODXLO00592 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PODXLO00592 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PODXLO00592 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PODXLO00592 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PODXLO00592 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PODXLO00592 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PODXLO00592 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PODXLO00592 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PODXLO00592 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PODXLO00592 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PODXLO00592 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PODXLO00592 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PODXLO00592 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PODXLO00592 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PODXLO00592 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PODXLO00592 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PODXLO00592 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PODXLO00592 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PODXLO00592 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PODXLO00592 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PODXLO00592 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PODXLO00592 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PODXLO00592 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PODXLO00592 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PODXLO00592 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PODXLO00592 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PODXLO00592 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PODXLO00592 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PODXLO00592 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PODXLO00592 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PODXLO00592 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PODXLO00592 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PODXLO00592 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PODXLO00592 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PODXLO00592 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PODXLO00592 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PODXLO00592 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PODXLO00592 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PODXLO00592 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PODXLO00592 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PODXLO00592 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PODXLO00592 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PODXLO00592 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PODXLO00592 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PODXLO00592 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PODXLO00592 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PODXLO00592 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PODXLO00592 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PODXLO00592 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms