Protein–RNA interactions for Protein: O00468

AGRN, Agrin, humanhuman

Predictions only

Length 2,067 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGRNO00468 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGRNO00468 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGRNO00468 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGRNO00468 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGRNO00468 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGRNO00468 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGRNO00468 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGRNO00468 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGRNO00468 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGRNO00468 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGRNO00468 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGRNO00468 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGRNO00468 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGRNO00468 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGRNO00468 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGRNO00468 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
AGRNO00468 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGRNO00468 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGRNO00468 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGRNO00468 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AGRNO00468 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
AGRNO00468 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGRNO00468 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGRNO00468 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGRNO00468 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGRNO00468 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGRNO00468 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGRNO00468 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGRNO00468 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGRNO00468 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGRNO00468 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGRNO00468 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGRNO00468 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGRNO00468 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGRNO00468 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGRNO00468 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGRNO00468 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGRNO00468 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGRNO00468 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGRNO00468 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGRNO00468 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGRNO00468 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AGRNO00468 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AGRNO00468 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AGRNO00468 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AGRNO00468 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AGRNO00468 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AGRNO00468 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AGRNO00468 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AGRNO00468 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AGRNO00468 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AGRNO00468 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AGRNO00468 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AGRNO00468 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
AGRNO00468 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AGRNO00468 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AGRNO00468 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AGRNO00468 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AGRNO00468 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
AGRNO00468 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AGRNO00468 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AGRNO00468 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AGRNO00468 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AGRNO00468 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AGRNO00468 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AGRNO00468 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AGRNO00468 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AGRNO00468 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AGRNO00468 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AGRNO00468 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AGRNO00468 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AGRNO00468 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AGRNO00468 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AGRNO00468 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AGRNO00468 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AGRNO00468 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
AGRNO00468 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AGRNO00468 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AGRNO00468 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AGRNO00468 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AGRNO00468 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AGRNO00468 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AGRNO00468 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AGRNO00468 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AGRNO00468 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AGRNO00468 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AGRNO00468 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AGRNO00468 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AGRNO00468 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AGRNO00468 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AGRNO00468 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AGRNO00468 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AGRNO00468 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
AGRNO00468 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
AGRNO00468 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AGRNO00468 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AGRNO00468 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
AGRNO00468 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AGRNO00468 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
AGRNO00468 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms