Protein–RNA interactions for Protein: J3QLW9

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QLW9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
J3QLW9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
J3QLW9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
J3QLW9 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
J3QLW9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
J3QLW9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
J3QLW9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
J3QLW9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
J3QLW9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
J3QLW9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
J3QLW9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
J3QLW9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
J3QLW9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
J3QLW9 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
J3QLW9 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
J3QLW9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
J3QLW9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
J3QLW9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
J3QLW9 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
J3QLW9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
J3QLW9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
J3QLW9 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
J3QLW9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
J3QLW9 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
J3QLW9 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
J3QLW9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
J3QLW9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
J3QLW9 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
J3QLW9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
J3QLW9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
J3QLW9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
J3QLW9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
J3QLW9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
J3QLW9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
J3QLW9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
J3QLW9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
J3QLW9 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
J3QLW9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
J3QLW9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
J3QLW9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
J3QLW9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
J3QLW9 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
J3QLW9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
J3QLW9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
J3QLW9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
J3QLW9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
J3QLW9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
J3QLW9 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
J3QLW9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
J3QLW9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
J3QLW9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
J3QLW9 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
J3QLW9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
J3QLW9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
J3QLW9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
J3QLW9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
J3QLW9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
J3QLW9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
J3QLW9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
J3QLW9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
J3QLW9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
J3QLW9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
J3QLW9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
J3QLW9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
J3QLW9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
J3QLW9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
J3QLW9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
J3QLW9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
J3QLW9 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
J3QLW9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
J3QLW9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
J3QLW9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
J3QLW9 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
J3QLW9 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
J3QLW9 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
J3QLW9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
J3QLW9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
J3QLW9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
J3QLW9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
J3QLW9 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
J3QLW9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
J3QLW9 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
J3QLW9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
J3QLW9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
J3QLW9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
J3QLW9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
J3QLW9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
J3QLW9 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
J3QLW9 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
J3QLW9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
J3QLW9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
J3QLW9 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
J3QLW9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
J3QLW9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
J3QLW9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
J3QLW9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
J3QLW9 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
J3QLW9 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
J3QLW9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
J3QLW9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms