Protein–RNA interactions for Protein: H7C1W4

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1W4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
H7C1W4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
H7C1W4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
H7C1W4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
H7C1W4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
H7C1W4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
H7C1W4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
H7C1W4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
H7C1W4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
H7C1W4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
H7C1W4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
H7C1W4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
H7C1W4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
H7C1W4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
H7C1W4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
H7C1W4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
H7C1W4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
H7C1W4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
H7C1W4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
H7C1W4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
H7C1W4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
H7C1W4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
H7C1W4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
H7C1W4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
H7C1W4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
H7C1W4 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
H7C1W4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
H7C1W4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
H7C1W4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
H7C1W4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
H7C1W4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
H7C1W4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
H7C1W4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
H7C1W4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
H7C1W4 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
H7C1W4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
H7C1W4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
H7C1W4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
H7C1W4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
H7C1W4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
H7C1W4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
H7C1W4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
H7C1W4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
H7C1W4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
H7C1W4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
H7C1W4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
H7C1W4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
H7C1W4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
H7C1W4 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
H7C1W4 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
H7C1W4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
H7C1W4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
H7C1W4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
H7C1W4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
H7C1W4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
H7C1W4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
H7C1W4 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
H7C1W4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
H7C1W4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
H7C1W4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
H7C1W4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
H7C1W4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
H7C1W4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
H7C1W4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
H7C1W4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
H7C1W4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
H7C1W4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
H7C1W4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
H7C1W4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
H7C1W4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
H7C1W4 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
H7C1W4 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
H7C1W4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
H7C1W4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
H7C1W4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
H7C1W4 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
H7C1W4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
H7C1W4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
H7C1W4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
H7C1W4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
H7C1W4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
H7C1W4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
H7C1W4 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
H7C1W4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
H7C1W4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
H7C1W4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
H7C1W4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
H7C1W4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
H7C1W4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
H7C1W4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
H7C1W4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
H7C1W4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
H7C1W4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
H7C1W4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
H7C1W4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
H7C1W4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
H7C1W4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
H7C1W4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
H7C1W4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
H7C1W4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms