Protein–RNA interactions for Protein: H3BM21

Integrin beta (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BM21 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
H3BM21 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
H3BM21 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
H3BM21 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
H3BM21 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
H3BM21 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
H3BM21 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
H3BM21 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
H3BM21 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
H3BM21 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
H3BM21 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
H3BM21 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
H3BM21 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
H3BM21 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
H3BM21 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
H3BM21 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
H3BM21 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
H3BM21 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
H3BM21 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
H3BM21 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
H3BM21 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
H3BM21 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
H3BM21 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
H3BM21 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
H3BM21 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
H3BM21 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
H3BM21 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
H3BM21 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
H3BM21 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
H3BM21 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
H3BM21 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
H3BM21 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
H3BM21 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
H3BM21 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
H3BM21 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
H3BM21 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
H3BM21 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
H3BM21 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
H3BM21 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
H3BM21 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
H3BM21 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
H3BM21 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
H3BM21 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
H3BM21 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
H3BM21 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
H3BM21 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
H3BM21 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
H3BM21 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
H3BM21 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
H3BM21 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
H3BM21 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
H3BM21 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
H3BM21 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
H3BM21 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
H3BM21 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
H3BM21 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
H3BM21 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
H3BM21 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
H3BM21 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
H3BM21 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
H3BM21 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
H3BM21 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
H3BM21 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
H3BM21 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
H3BM21 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
H3BM21 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
H3BM21 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
H3BM21 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
H3BM21 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
H3BM21 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
H3BM21 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
H3BM21 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
H3BM21 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
H3BM21 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
H3BM21 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
H3BM21 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
H3BM21 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
H3BM21 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
H3BM21 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
H3BM21 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
H3BM21 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
H3BM21 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
H3BM21 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
H3BM21 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
H3BM21 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H3BM21 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
H3BM21 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
H3BM21 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H3BM21 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H3BM21 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H3BM21 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
H3BM21 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
H3BM21 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
H3BM21 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
H3BM21 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
H3BM21 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
H3BM21 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
H3BM21 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
H3BM21 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
H3BM21 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms