Protein–RNA interactions for Protein: E9PJ23

NPIPB6, Nuclear pore complex-interacting protein family member B6, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB6E9PJ23 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NPIPB6E9PJ23 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NPIPB6E9PJ23 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NPIPB6E9PJ23 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NPIPB6E9PJ23 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NPIPB6E9PJ23 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NPIPB6E9PJ23 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NPIPB6E9PJ23 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NPIPB6E9PJ23 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NPIPB6E9PJ23 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NPIPB6E9PJ23 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NPIPB6E9PJ23 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NPIPB6E9PJ23 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NPIPB6E9PJ23 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NPIPB6E9PJ23 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NPIPB6E9PJ23 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NPIPB6E9PJ23 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NPIPB6E9PJ23 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NPIPB6E9PJ23 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NPIPB6E9PJ23 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NPIPB6E9PJ23 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NPIPB6E9PJ23 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NPIPB6E9PJ23 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NPIPB6E9PJ23 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NPIPB6E9PJ23 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NPIPB6E9PJ23 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NPIPB6E9PJ23 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NPIPB6E9PJ23 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NPIPB6E9PJ23 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NPIPB6E9PJ23 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NPIPB6E9PJ23 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NPIPB6E9PJ23 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NPIPB6E9PJ23 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NPIPB6E9PJ23 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NPIPB6E9PJ23 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NPIPB6E9PJ23 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NPIPB6E9PJ23 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NPIPB6E9PJ23 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NPIPB6E9PJ23 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NPIPB6E9PJ23 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NPIPB6E9PJ23 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NPIPB6E9PJ23 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NPIPB6E9PJ23 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NPIPB6E9PJ23 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NPIPB6E9PJ23 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NPIPB6E9PJ23 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NPIPB6E9PJ23 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NPIPB6E9PJ23 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
NPIPB6E9PJ23 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NPIPB6E9PJ23 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NPIPB6E9PJ23 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NPIPB6E9PJ23 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NPIPB6E9PJ23 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NPIPB6E9PJ23 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NPIPB6E9PJ23 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NPIPB6E9PJ23 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NPIPB6E9PJ23 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NPIPB6E9PJ23 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NPIPB6E9PJ23 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NPIPB6E9PJ23 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NPIPB6E9PJ23 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NPIPB6E9PJ23 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NPIPB6E9PJ23 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NPIPB6E9PJ23 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NPIPB6E9PJ23 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NPIPB6E9PJ23 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NPIPB6E9PJ23 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NPIPB6E9PJ23 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NPIPB6E9PJ23 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NPIPB6E9PJ23 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NPIPB6E9PJ23 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NPIPB6E9PJ23 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NPIPB6E9PJ23 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NPIPB6E9PJ23 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NPIPB6E9PJ23 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NPIPB6E9PJ23 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NPIPB6E9PJ23 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NPIPB6E9PJ23 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NPIPB6E9PJ23 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NPIPB6E9PJ23 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NPIPB6E9PJ23 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NPIPB6E9PJ23 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NPIPB6E9PJ23 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NPIPB6E9PJ23 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NPIPB6E9PJ23 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NPIPB6E9PJ23 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NPIPB6E9PJ23 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
NPIPB6E9PJ23 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NPIPB6E9PJ23 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NPIPB6E9PJ23 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NPIPB6E9PJ23 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NPIPB6E9PJ23 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NPIPB6E9PJ23 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NPIPB6E9PJ23 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NPIPB6E9PJ23 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NPIPB6E9PJ23 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NPIPB6E9PJ23 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NPIPB6E9PJ23 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NPIPB6E9PJ23 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NPIPB6E9PJ23 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms