Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM1B2RUZ4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM1B2RUZ4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM1B2RUZ4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM1B2RUZ4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM1B2RUZ4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM1B2RUZ4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM1B2RUZ4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM1B2RUZ4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM1B2RUZ4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM1B2RUZ4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM1B2RUZ4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM1B2RUZ4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM1B2RUZ4 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM1B2RUZ4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM1B2RUZ4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM1B2RUZ4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM1B2RUZ4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM1B2RUZ4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM1B2RUZ4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM1B2RUZ4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM1B2RUZ4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM1B2RUZ4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM1B2RUZ4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM1B2RUZ4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM1B2RUZ4 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM1B2RUZ4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM1B2RUZ4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM1B2RUZ4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM1B2RUZ4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM1B2RUZ4 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM1B2RUZ4 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM1B2RUZ4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM1B2RUZ4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM1B2RUZ4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM1B2RUZ4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM1B2RUZ4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM1B2RUZ4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM1B2RUZ4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM1B2RUZ4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM1B2RUZ4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM1B2RUZ4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM1B2RUZ4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMIM1B2RUZ4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMIM1B2RUZ4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMIM1B2RUZ4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMIM1B2RUZ4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMIM1B2RUZ4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMIM1B2RUZ4 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMIM1B2RUZ4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM1B2RUZ4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM1B2RUZ4 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM1B2RUZ4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM1B2RUZ4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM1B2RUZ4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM1B2RUZ4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM1B2RUZ4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM1B2RUZ4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM1B2RUZ4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM1B2RUZ4 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM1B2RUZ4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM1B2RUZ4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM1B2RUZ4 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM1B2RUZ4 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM1B2RUZ4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM1B2RUZ4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM1B2RUZ4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM1B2RUZ4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM1B2RUZ4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM1B2RUZ4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM1B2RUZ4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM1B2RUZ4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM1B2RUZ4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM1B2RUZ4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM1B2RUZ4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM1B2RUZ4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM1B2RUZ4 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM1B2RUZ4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM1B2RUZ4 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM1B2RUZ4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM1B2RUZ4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM1B2RUZ4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM1B2RUZ4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM1B2RUZ4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM1B2RUZ4 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM1B2RUZ4 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM1B2RUZ4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM1B2RUZ4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM1B2RUZ4 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM1B2RUZ4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM1B2RUZ4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM1B2RUZ4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM1B2RUZ4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM1B2RUZ4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM1B2RUZ4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM1B2RUZ4 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM1B2RUZ4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM1B2RUZ4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM1B2RUZ4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM1B2RUZ4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms