Protein–RNA interactions for Protein: A6NIX2

WTIP, Wilms tumor protein 1-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WTIPA6NIX2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
WTIPA6NIX2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
WTIPA6NIX2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
WTIPA6NIX2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
WTIPA6NIX2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
WTIPA6NIX2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
WTIPA6NIX2 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
WTIPA6NIX2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
WTIPA6NIX2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
WTIPA6NIX2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
WTIPA6NIX2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
WTIPA6NIX2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
WTIPA6NIX2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
WTIPA6NIX2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
WTIPA6NIX2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
WTIPA6NIX2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
WTIPA6NIX2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
WTIPA6NIX2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
WTIPA6NIX2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
WTIPA6NIX2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
WTIPA6NIX2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
WTIPA6NIX2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
WTIPA6NIX2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
WTIPA6NIX2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
WTIPA6NIX2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
WTIPA6NIX2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
WTIPA6NIX2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
WTIPA6NIX2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
WTIPA6NIX2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
WTIPA6NIX2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
WTIPA6NIX2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
WTIPA6NIX2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
WTIPA6NIX2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
WTIPA6NIX2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
WTIPA6NIX2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
WTIPA6NIX2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
WTIPA6NIX2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
WTIPA6NIX2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
WTIPA6NIX2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
WTIPA6NIX2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
WTIPA6NIX2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
WTIPA6NIX2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
WTIPA6NIX2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
WTIPA6NIX2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
WTIPA6NIX2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
WTIPA6NIX2 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
WTIPA6NIX2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
WTIPA6NIX2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
WTIPA6NIX2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
WTIPA6NIX2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
WTIPA6NIX2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
WTIPA6NIX2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
WTIPA6NIX2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
WTIPA6NIX2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
WTIPA6NIX2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
WTIPA6NIX2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
WTIPA6NIX2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
WTIPA6NIX2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
WTIPA6NIX2 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
WTIPA6NIX2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
WTIPA6NIX2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
WTIPA6NIX2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
WTIPA6NIX2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
WTIPA6NIX2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
WTIPA6NIX2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
WTIPA6NIX2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
WTIPA6NIX2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
WTIPA6NIX2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
WTIPA6NIX2 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
WTIPA6NIX2 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
WTIPA6NIX2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
WTIPA6NIX2 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
WTIPA6NIX2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
WTIPA6NIX2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
WTIPA6NIX2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
WTIPA6NIX2 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
WTIPA6NIX2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
WTIPA6NIX2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
WTIPA6NIX2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
WTIPA6NIX2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
WTIPA6NIX2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
WTIPA6NIX2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
WTIPA6NIX2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
WTIPA6NIX2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
WTIPA6NIX2 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
WTIPA6NIX2 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
WTIPA6NIX2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
WTIPA6NIX2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
WTIPA6NIX2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
WTIPA6NIX2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
WTIPA6NIX2 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
WTIPA6NIX2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
WTIPA6NIX2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
WTIPA6NIX2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
WTIPA6NIX2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
WTIPA6NIX2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
WTIPA6NIX2 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
WTIPA6NIX2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
WTIPA6NIX2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
WTIPA6NIX2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms