Protein–RNA interactions for Protein: A6NFI3

ZNF316, Zinc finger protein 316, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF316A6NFI3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
ZNF316A6NFI3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
ZNF316A6NFI3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
ZNF316A6NFI3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
ZNF316A6NFI3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
ZNF316A6NFI3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
ZNF316A6NFI3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC32.79■■■□□ 2.84
ZNF316A6NFI3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
ZNF316A6NFI3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
ZNF316A6NFI3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
ZNF316A6NFI3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
ZNF316A6NFI3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
ZNF316A6NFI3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
ZNF316A6NFI3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
ZNF316A6NFI3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
ZNF316A6NFI3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
ZNF316A6NFI3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
ZNF316A6NFI3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
ZNF316A6NFI3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
ZNF316A6NFI3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC32.78■■■□□ 2.84
ZNF316A6NFI3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
ZNF316A6NFI3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC32.77■■■□□ 2.84
ZNF316A6NFI3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC32.77■■■□□ 2.84
ZNF316A6NFI3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
ZNF316A6NFI3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
ZNF316A6NFI3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
ZNF316A6NFI3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
ZNF316A6NFI3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
ZNF316A6NFI3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
ZNF316A6NFI3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
ZNF316A6NFI3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
ZNF316A6NFI3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
ZNF316A6NFI3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
ZNF316A6NFI3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
ZNF316A6NFI3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
ZNF316A6NFI3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
ZNF316A6NFI3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
ZNF316A6NFI3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
ZNF316A6NFI3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
ZNF316A6NFI3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
ZNF316A6NFI3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
ZNF316A6NFI3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
ZNF316A6NFI3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
ZNF316A6NFI3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
ZNF316A6NFI3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
ZNF316A6NFI3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
ZNF316A6NFI3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
ZNF316A6NFI3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
ZNF316A6NFI3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
ZNF316A6NFI3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
ZNF316A6NFI3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
ZNF316A6NFI3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
ZNF316A6NFI3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
ZNF316A6NFI3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
ZNF316A6NFI3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
ZNF316A6NFI3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
ZNF316A6NFI3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
ZNF316A6NFI3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
ZNF316A6NFI3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
ZNF316A6NFI3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
ZNF316A6NFI3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
ZNF316A6NFI3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
ZNF316A6NFI3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
ZNF316A6NFI3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
ZNF316A6NFI3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
ZNF316A6NFI3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
ZNF316A6NFI3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
ZNF316A6NFI3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
ZNF316A6NFI3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
ZNF316A6NFI3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
ZNF316A6NFI3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
ZNF316A6NFI3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
ZNF316A6NFI3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
ZNF316A6NFI3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
ZNF316A6NFI3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
ZNF316A6NFI3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
ZNF316A6NFI3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
ZNF316A6NFI3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
ZNF316A6NFI3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
ZNF316A6NFI3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
ZNF316A6NFI3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
ZNF316A6NFI3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
ZNF316A6NFI3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
ZNF316A6NFI3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
ZNF316A6NFI3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
ZNF316A6NFI3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
ZNF316A6NFI3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
ZNF316A6NFI3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
ZNF316A6NFI3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
ZNF316A6NFI3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
ZNF316A6NFI3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
ZNF316A6NFI3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
ZNF316A6NFI3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
ZNF316A6NFI3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
ZNF316A6NFI3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
ZNF316A6NFI3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
ZNF316A6NFI3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
ZNF316A6NFI3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
ZNF316A6NFI3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
ZNF316A6NFI3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms