Protein–RNA interactions for Protein: A6NCL1

GMNC, Geminin coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMNCA6NCL1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GMNCA6NCL1 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GMNCA6NCL1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GMNCA6NCL1 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GMNCA6NCL1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GMNCA6NCL1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GMNCA6NCL1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GMNCA6NCL1 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GMNCA6NCL1 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GMNCA6NCL1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GMNCA6NCL1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GMNCA6NCL1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GMNCA6NCL1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GMNCA6NCL1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GMNCA6NCL1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GMNCA6NCL1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GMNCA6NCL1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GMNCA6NCL1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GMNCA6NCL1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GMNCA6NCL1 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GMNCA6NCL1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GMNCA6NCL1 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GMNCA6NCL1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GMNCA6NCL1 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GMNCA6NCL1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GMNCA6NCL1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GMNCA6NCL1 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GMNCA6NCL1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GMNCA6NCL1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GMNCA6NCL1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GMNCA6NCL1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GMNCA6NCL1 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GMNCA6NCL1 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GMNCA6NCL1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GMNCA6NCL1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GMNCA6NCL1 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GMNCA6NCL1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GMNCA6NCL1 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GMNCA6NCL1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GMNCA6NCL1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GMNCA6NCL1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GMNCA6NCL1 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GMNCA6NCL1 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GMNCA6NCL1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GMNCA6NCL1 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GMNCA6NCL1 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GMNCA6NCL1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GMNCA6NCL1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GMNCA6NCL1 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GMNCA6NCL1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GMNCA6NCL1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GMNCA6NCL1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GMNCA6NCL1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GMNCA6NCL1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GMNCA6NCL1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GMNCA6NCL1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GMNCA6NCL1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GMNCA6NCL1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GMNCA6NCL1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GMNCA6NCL1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GMNCA6NCL1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GMNCA6NCL1 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GMNCA6NCL1 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GMNCA6NCL1 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GMNCA6NCL1 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GMNCA6NCL1 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GMNCA6NCL1 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GMNCA6NCL1 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GMNCA6NCL1 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GMNCA6NCL1 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GMNCA6NCL1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GMNCA6NCL1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GMNCA6NCL1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GMNCA6NCL1 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GMNCA6NCL1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GMNCA6NCL1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GMNCA6NCL1 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GMNCA6NCL1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GMNCA6NCL1 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GMNCA6NCL1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GMNCA6NCL1 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GMNCA6NCL1 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GMNCA6NCL1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GMNCA6NCL1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GMNCA6NCL1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GMNCA6NCL1 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GMNCA6NCL1 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GMNCA6NCL1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GMNCA6NCL1 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GMNCA6NCL1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GMNCA6NCL1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GMNCA6NCL1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GMNCA6NCL1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GMNCA6NCL1 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GMNCA6NCL1 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GMNCA6NCL1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GMNCA6NCL1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GMNCA6NCL1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GMNCA6NCL1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GMNCA6NCL1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms