Protein–RNA interactions for Protein: A2RUB6

CCDC66, Coiled-coil domain-containing protein 66, humanhuman

Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC66A2RUB6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC66A2RUB6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC66A2RUB6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC66A2RUB6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC66A2RUB6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC66A2RUB6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC66A2RUB6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC66A2RUB6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC66A2RUB6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC66A2RUB6 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC66A2RUB6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC66A2RUB6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC66A2RUB6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC66A2RUB6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC66A2RUB6 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC66A2RUB6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC66A2RUB6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC66A2RUB6 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC66A2RUB6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC66A2RUB6 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC66A2RUB6 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC66A2RUB6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC66A2RUB6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC66A2RUB6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC66A2RUB6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC66A2RUB6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC66A2RUB6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC66A2RUB6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC66A2RUB6 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC66A2RUB6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC66A2RUB6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC66A2RUB6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC66A2RUB6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC66A2RUB6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC66A2RUB6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC66A2RUB6 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC66A2RUB6 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC66A2RUB6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC66A2RUB6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC66A2RUB6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC66A2RUB6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC66A2RUB6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC66A2RUB6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC66A2RUB6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC66A2RUB6 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC66A2RUB6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC66A2RUB6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC66A2RUB6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC66A2RUB6 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC66A2RUB6 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC66A2RUB6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC66A2RUB6 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC66A2RUB6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC66A2RUB6 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC66A2RUB6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC66A2RUB6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC66A2RUB6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC66A2RUB6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC66A2RUB6 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC66A2RUB6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC66A2RUB6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC66A2RUB6 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC66A2RUB6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC66A2RUB6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC66A2RUB6 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC66A2RUB6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC66A2RUB6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC66A2RUB6 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC66A2RUB6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC66A2RUB6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC66A2RUB6 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC66A2RUB6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC66A2RUB6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC66A2RUB6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC66A2RUB6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC66A2RUB6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC66A2RUB6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC66A2RUB6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC66A2RUB6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC66A2RUB6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC66A2RUB6 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC66A2RUB6 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC66A2RUB6 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC66A2RUB6 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC66A2RUB6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC66A2RUB6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC66A2RUB6 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC66A2RUB6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC66A2RUB6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC66A2RUB6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC66A2RUB6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC66A2RUB6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC66A2RUB6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC66A2RUB6 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC66A2RUB6 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC66A2RUB6 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC66A2RUB6 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC66A2RUB6 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC66A2RUB6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC66A2RUB6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms