Protein–RNA interactions for Protein: A0AVF1

TTC26, Intraflagellar transport protein 56, humanhuman

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Length 554 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC26A0AVF1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TTC26A0AVF1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TTC26A0AVF1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TTC26A0AVF1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TTC26A0AVF1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TTC26A0AVF1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TTC26A0AVF1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TTC26A0AVF1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TTC26A0AVF1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TTC26A0AVF1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TTC26A0AVF1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TTC26A0AVF1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TTC26A0AVF1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TTC26A0AVF1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TTC26A0AVF1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TTC26A0AVF1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TTC26A0AVF1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TTC26A0AVF1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TTC26A0AVF1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TTC26A0AVF1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TTC26A0AVF1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TTC26A0AVF1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TTC26A0AVF1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TTC26A0AVF1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TTC26A0AVF1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TTC26A0AVF1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TTC26A0AVF1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TTC26A0AVF1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TTC26A0AVF1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TTC26A0AVF1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TTC26A0AVF1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TTC26A0AVF1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TTC26A0AVF1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TTC26A0AVF1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TTC26A0AVF1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TTC26A0AVF1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TTC26A0AVF1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TTC26A0AVF1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TTC26A0AVF1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TTC26A0AVF1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TTC26A0AVF1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TTC26A0AVF1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TTC26A0AVF1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TTC26A0AVF1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TTC26A0AVF1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TTC26A0AVF1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TTC26A0AVF1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TTC26A0AVF1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TTC26A0AVF1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TTC26A0AVF1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TTC26A0AVF1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TTC26A0AVF1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TTC26A0AVF1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TTC26A0AVF1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TTC26A0AVF1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TTC26A0AVF1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TTC26A0AVF1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TTC26A0AVF1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TTC26A0AVF1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TTC26A0AVF1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TTC26A0AVF1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TTC26A0AVF1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TTC26A0AVF1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TTC26A0AVF1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TTC26A0AVF1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TTC26A0AVF1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TTC26A0AVF1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TTC26A0AVF1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TTC26A0AVF1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TTC26A0AVF1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TTC26A0AVF1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TTC26A0AVF1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TTC26A0AVF1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TTC26A0AVF1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TTC26A0AVF1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TTC26A0AVF1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TTC26A0AVF1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TTC26A0AVF1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TTC26A0AVF1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TTC26A0AVF1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TTC26A0AVF1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TTC26A0AVF1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TTC26A0AVF1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TTC26A0AVF1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TTC26A0AVF1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TTC26A0AVF1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TTC26A0AVF1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TTC26A0AVF1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TTC26A0AVF1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TTC26A0AVF1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TTC26A0AVF1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TTC26A0AVF1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TTC26A0AVF1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TTC26A0AVF1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TTC26A0AVF1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TTC26A0AVF1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TTC26A0AVF1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TTC26A0AVF1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TTC26A0AVF1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TTC26A0AVF1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
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