Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YXV3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0J9YXV3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
A0A0J9YXV3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
A0A0J9YXV3 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
A0A0J9YXV3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
A0A0J9YXV3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
A0A0J9YXV3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
A0A0J9YXV3 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
A0A0J9YXV3 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
A0A0J9YXV3 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
A0A0J9YXV3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
A0A0J9YXV3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
A0A0J9YXV3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
A0A0J9YXV3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
A0A0J9YXV3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
A0A0J9YXV3 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
A0A0J9YXV3 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
A0A0J9YXV3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
A0A0J9YXV3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
A0A0J9YXV3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
A0A0J9YXV3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
A0A0J9YXV3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
A0A0J9YXV3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
A0A0J9YXV3 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
A0A0J9YXV3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
A0A0J9YXV3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
A0A0J9YXV3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
A0A0J9YXV3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
A0A0J9YXV3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
A0A0J9YXV3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
A0A0J9YXV3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
A0A0J9YXV3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
A0A0J9YXV3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
A0A0J9YXV3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
A0A0J9YXV3 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
A0A0J9YXV3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
A0A0J9YXV3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
A0A0J9YXV3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
A0A0J9YXV3 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
A0A0J9YXV3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
A0A0J9YXV3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
A0A0J9YXV3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
A0A0J9YXV3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
A0A0J9YXV3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
A0A0J9YXV3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
A0A0J9YXV3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
A0A0J9YXV3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
A0A0J9YXV3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
A0A0J9YXV3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
A0A0J9YXV3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
A0A0J9YXV3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
A0A0J9YXV3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
A0A0J9YXV3 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
A0A0J9YXV3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
A0A0J9YXV3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
A0A0J9YXV3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
A0A0J9YXV3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
A0A0J9YXV3 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
A0A0J9YXV3 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
A0A0J9YXV3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
A0A0J9YXV3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
A0A0J9YXV3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
A0A0J9YXV3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
A0A0J9YXV3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
A0A0J9YXV3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
A0A0J9YXV3 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
A0A0J9YXV3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
A0A0J9YXV3 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
A0A0J9YXV3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
A0A0J9YXV3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
A0A0J9YXV3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
A0A0J9YXV3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
A0A0J9YXV3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
A0A0J9YXV3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
A0A0J9YXV3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
A0A0J9YXV3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
A0A0J9YXV3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
A0A0J9YXV3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
A0A0J9YXV3 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
A0A0J9YXV3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
A0A0J9YXV3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
A0A0J9YXV3 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
A0A0J9YXV3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
A0A0J9YXV3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
A0A0J9YXV3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
A0A0J9YXV3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
A0A0J9YXV3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
A0A0J9YXV3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
A0A0J9YXV3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
A0A0J9YXV3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
A0A0J9YXV3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
A0A0J9YXV3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
A0A0J9YXV3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
A0A0J9YXV3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
A0A0J9YXV3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
A0A0J9YXV3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
A0A0J9YXV3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
A0A0J9YXV3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
A0A0J9YXV3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
A0A0J9YXV3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
A0A0J9YXV3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms