Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNS2

COPS3, COP9 signalosome complex subunit 3, humanhuman

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Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS3Q9UNS2 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
COPS3Q9UNS2 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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