Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL01

DSE, Dermatan-sulfate epimerase, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSEQ9UL01 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DSEQ9UL01 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DSEQ9UL01 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DSEQ9UL01 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DSEQ9UL01 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DSEQ9UL01 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DSEQ9UL01 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DSEQ9UL01 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DSEQ9UL01 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DSEQ9UL01 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DSEQ9UL01 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DSEQ9UL01 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DSEQ9UL01 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSEQ9UL01 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DSEQ9UL01 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSEQ9UL01 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DSEQ9UL01 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSEQ9UL01 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSEQ9UL01 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSEQ9UL01 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSEQ9UL01 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DSEQ9UL01 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSEQ9UL01 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSEQ9UL01 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSEQ9UL01 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSEQ9UL01 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSEQ9UL01 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSEQ9UL01 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSEQ9UL01 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSEQ9UL01 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DSEQ9UL01 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSEQ9UL01 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSEQ9UL01 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSEQ9UL01 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DSEQ9UL01 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DSEQ9UL01 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSEQ9UL01 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSEQ9UL01 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSEQ9UL01 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSEQ9UL01 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSEQ9UL01 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DSEQ9UL01 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSEQ9UL01 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSEQ9UL01 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSEQ9UL01 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSEQ9UL01 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSEQ9UL01 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSEQ9UL01 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSEQ9UL01 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSEQ9UL01 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DSEQ9UL01 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSEQ9UL01 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSEQ9UL01 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DSEQ9UL01 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms