Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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FOXD3Q9UJU5 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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