Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms