Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBM1

PEMT, Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEMTQ9UBM1 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 PRPF38A-201ENST00000257181 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 GAB1-202ENST00000262995 7981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 SEZ6L-203ENST00000360929 6307 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms