Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBL6

CPNE7, Copine-7, humanhuman

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Length 633 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE7Q9UBL6 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CPNE7Q9UBL6 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CPNE7Q9UBL6 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CPNE7Q9UBL6 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CPNE7Q9UBL6 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CPNE7Q9UBL6 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CPNE7Q9UBL6 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CPNE7Q9UBL6 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CPNE7Q9UBL6 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CPNE7Q9UBL6 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CPNE7Q9UBL6 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CPNE7Q9UBL6 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CPNE7Q9UBL6 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CPNE7Q9UBL6 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CPNE7Q9UBL6 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CPNE7Q9UBL6 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CPNE7Q9UBL6 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CPNE7Q9UBL6 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CPNE7Q9UBL6 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CPNE7Q9UBL6 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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CPNE7Q9UBL6 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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CPNE7Q9UBL6 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CPNE7Q9UBL6 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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CPNE7Q9UBL6 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CPNE7Q9UBL6 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CPNE7Q9UBL6 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CPNE7Q9UBL6 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CPNE7Q9UBL6 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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CPNE7Q9UBL6 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CPNE7Q9UBL6 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CPNE7Q9UBL6 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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CPNE7Q9UBL6 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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CPNE7Q9UBL6 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CPNE7Q9UBL6 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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CPNE7Q9UBL6 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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CPNE7Q9UBL6 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
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CPNE7Q9UBL6 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CPNE7Q9UBL6 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CPNE7Q9UBL6 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CPNE7Q9UBL6 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CPNE7Q9UBL6 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CPNE7Q9UBL6 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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