Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SH3BP4Q9P0V3 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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SH3BP4Q9P0V3 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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SH3BP4Q9P0V3 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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SH3BP4Q9P0V3 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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SH3BP4Q9P0V3 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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SH3BP4Q9P0V3 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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SH3BP4Q9P0V3 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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SH3BP4Q9P0V3 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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SH3BP4Q9P0V3 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3BP4Q9P0V3 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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