Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
PDGFDQ9GZP0 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PDGFDQ9GZP0 EFHD1-207ENST00000611312 1490 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
PDGFDQ9GZP0 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDGFDQ9GZP0 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDGFDQ9GZP0 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDGFDQ9GZP0 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDGFDQ9GZP0 RPL10-202ENST00000369817 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDGFDQ9GZP0 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDGFDQ9GZP0 PPP1R7-205ENST00000404405 1009 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDGFDQ9GZP0 AC092570.1-201ENST00000414446 469 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PDGFDQ9GZP0 LINC00483-202ENST00000419688 558 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDGFDQ9GZP0 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDGFDQ9GZP0 TXNL4B-203ENST00000426362 965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDGFDQ9GZP0 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PDGFDQ9GZP0 RN7SL846P-201ENST00000467429 292 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PDGFDQ9GZP0 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PDGFDQ9GZP0 AC090136.2-201ENST00000517809 420 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PDGFDQ9GZP0 ORAOV1-205ENST00000535657 709 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDGFDQ9GZP0 APOPT1-215ENST00000556253 783 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDGFDQ9GZP0 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PDGFDQ9GZP0 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDGFDQ9GZP0 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDGFDQ9GZP0 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDGFDQ9GZP0 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDGFDQ9GZP0 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDGFDQ9GZP0 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDGFDQ9GZP0 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDGFDQ9GZP0 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDGFDQ9GZP0 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDGFDQ9GZP0 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDGFDQ9GZP0 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDGFDQ9GZP0 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDGFDQ9GZP0 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDGFDQ9GZP0 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDGFDQ9GZP0 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDGFDQ9GZP0 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDGFDQ9GZP0 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDGFDQ9GZP0 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDGFDQ9GZP0 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDGFDQ9GZP0 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDGFDQ9GZP0 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDGFDQ9GZP0 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDGFDQ9GZP0 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDGFDQ9GZP0 KCNK9-201ENST00000303015 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDGFDQ9GZP0 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDGFDQ9GZP0 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDGFDQ9GZP0 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDGFDQ9GZP0 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDGFDQ9GZP0 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDGFDQ9GZP0 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PDGFDQ9GZP0 DDX39B-AS1-208ENST00000420520 516 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDGFDQ9GZP0 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PDGFDQ9GZP0 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDGFDQ9GZP0 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDGFDQ9GZP0 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDGFDQ9GZP0 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDGFDQ9GZP0 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PDGFDQ9GZP0 DHDDS-217ENST00000526219 1072 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDGFDQ9GZP0 C10orf113-201ENST00000529198 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDGFDQ9GZP0 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDGFDQ9GZP0 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDGFDQ9GZP0 AC007656.1-201ENST00000552238 573 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDGFDQ9GZP0 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PDGFDQ9GZP0 AC009065.6-201ENST00000568795 456 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDGFDQ9GZP0 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDGFDQ9GZP0 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDGFDQ9GZP0 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDGFDQ9GZP0 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDGFDQ9GZP0 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDGFDQ9GZP0 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDGFDQ9GZP0 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDGFDQ9GZP0 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDGFDQ9GZP0 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDGFDQ9GZP0 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDGFDQ9GZP0 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDGFDQ9GZP0 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDGFDQ9GZP0 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDGFDQ9GZP0 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDGFDQ9GZP0 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PDGFDQ9GZP0 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDGFDQ9GZP0 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDGFDQ9GZP0 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDGFDQ9GZP0 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDGFDQ9GZP0 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDGFDQ9GZP0 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDGFDQ9GZP0 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDGFDQ9GZP0 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDGFDQ9GZP0 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDGFDQ9GZP0 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDGFDQ9GZP0 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDGFDQ9GZP0 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDGFDQ9GZP0 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDGFDQ9GZP0 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDGFDQ9GZP0 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDGFDQ9GZP0 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDGFDQ9GZP0 TREM2-202ENST00000373113 1044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDGFDQ9GZP0 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDGFDQ9GZP0 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDGFDQ9GZP0 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms