Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D3

ZYG11B, Protein zyg-11 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZYG11BQ9C0D3 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms