Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 TMEM120B-204ENST00000449592 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 EIF2AK1-201ENST00000199389 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 GLI3-201ENST00000395925 8208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC9.69□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC9.69□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 MYT1-201ENST00000328439 5535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 SEMA6D-202ENST00000354744 5931 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC9.69□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC9.69□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 PRPF38A-201ENST00000257181 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 CNTNAP5-202ENST00000431078 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 LRRC8A-203ENST00000372600 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 UBFD1-207ENST00000567212 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms