Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NICN1Q9BSH3 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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