Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.1
HERPUD2Q9BSE4 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERPUD2Q9BSE4 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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