Protein–RNA interactions for Protein: Q99618

CDCA3, Cell division cycle-associated protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA3Q99618 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDCA3Q99618 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.5 ms