Protein–RNA interactions for Protein: Q99457

NAP1L3, Nucleosome assembly protein 1-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L3Q99457 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.14
NAP1L3Q99457 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NAP1L3Q99457 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NAP1L3Q99457 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NAP1L3Q99457 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NAP1L3Q99457 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NAP1L3Q99457 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NAP1L3Q99457 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NAP1L3Q99457 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NAP1L3Q99457 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NAP1L3Q99457 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NAP1L3Q99457 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NAP1L3Q99457 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NAP1L3Q99457 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NAP1L3Q99457 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NAP1L3Q99457 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NAP1L3Q99457 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NAP1L3Q99457 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NAP1L3Q99457 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NAP1L3Q99457 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NAP1L3Q99457 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NAP1L3Q99457 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NAP1L3Q99457 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NAP1L3Q99457 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NAP1L3Q99457 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NAP1L3Q99457 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NAP1L3Q99457 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NAP1L3Q99457 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NAP1L3Q99457 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NAP1L3Q99457 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NAP1L3Q99457 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NAP1L3Q99457 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NAP1L3Q99457 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NAP1L3Q99457 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NAP1L3Q99457 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NAP1L3Q99457 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NAP1L3Q99457 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NAP1L3Q99457 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NAP1L3Q99457 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NAP1L3Q99457 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NAP1L3Q99457 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NAP1L3Q99457 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NAP1L3Q99457 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NAP1L3Q99457 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NAP1L3Q99457 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NAP1L3Q99457 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms