Protein–RNA interactions for Protein: Q96SF2

CCT8L2, T-complex protein 1 subunit theta-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8L2Q96SF2 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CCT8L2Q96SF2 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCT8L2Q96SF2 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCT8L2Q96SF2 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCT8L2Q96SF2 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCT8L2Q96SF2 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCT8L2Q96SF2 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCT8L2Q96SF2 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCT8L2Q96SF2 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCT8L2Q96SF2 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCT8L2Q96SF2 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCT8L2Q96SF2 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCT8L2Q96SF2 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCT8L2Q96SF2 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCT8L2Q96SF2 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCT8L2Q96SF2 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCT8L2Q96SF2 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCT8L2Q96SF2 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCT8L2Q96SF2 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCT8L2Q96SF2 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCT8L2Q96SF2 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCT8L2Q96SF2 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCT8L2Q96SF2 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCT8L2Q96SF2 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCT8L2Q96SF2 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCT8L2Q96SF2 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCT8L2Q96SF2 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCT8L2Q96SF2 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCT8L2Q96SF2 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCT8L2Q96SF2 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCT8L2Q96SF2 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCT8L2Q96SF2 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCT8L2Q96SF2 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCT8L2Q96SF2 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCT8L2Q96SF2 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCT8L2Q96SF2 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCT8L2Q96SF2 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CCT8L2Q96SF2 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCT8L2Q96SF2 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCT8L2Q96SF2 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCT8L2Q96SF2 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCT8L2Q96SF2 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCT8L2Q96SF2 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCT8L2Q96SF2 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCT8L2Q96SF2 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCT8L2Q96SF2 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCT8L2Q96SF2 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CCT8L2Q96SF2 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCT8L2Q96SF2 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCT8L2Q96SF2 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CCT8L2Q96SF2 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCT8L2Q96SF2 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCT8L2Q96SF2 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCT8L2Q96SF2 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCT8L2Q96SF2 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCT8L2Q96SF2 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCT8L2Q96SF2 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCT8L2Q96SF2 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCT8L2Q96SF2 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCT8L2Q96SF2 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCT8L2Q96SF2 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCT8L2Q96SF2 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCT8L2Q96SF2 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCT8L2Q96SF2 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCT8L2Q96SF2 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCT8L2Q96SF2 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCT8L2Q96SF2 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCT8L2Q96SF2 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCT8L2Q96SF2 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCT8L2Q96SF2 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCT8L2Q96SF2 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCT8L2Q96SF2 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCT8L2Q96SF2 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCT8L2Q96SF2 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCT8L2Q96SF2 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCT8L2Q96SF2 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCT8L2Q96SF2 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCT8L2Q96SF2 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCT8L2Q96SF2 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCT8L2Q96SF2 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCT8L2Q96SF2 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCT8L2Q96SF2 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCT8L2Q96SF2 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCT8L2Q96SF2 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCT8L2Q96SF2 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CCT8L2Q96SF2 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCT8L2Q96SF2 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CCT8L2Q96SF2 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCT8L2Q96SF2 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCT8L2Q96SF2 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCT8L2Q96SF2 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCT8L2Q96SF2 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCT8L2Q96SF2 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCT8L2Q96SF2 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCT8L2Q96SF2 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCT8L2Q96SF2 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCT8L2Q96SF2 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCT8L2Q96SF2 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCT8L2Q96SF2 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCT8L2Q96SF2 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms