Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SGCZQ96LD1 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SGCZQ96LD1 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SGCZQ96LD1 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SGCZQ96LD1 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SGCZQ96LD1 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SGCZQ96LD1 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SGCZQ96LD1 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SGCZQ96LD1 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SGCZQ96LD1 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SGCZQ96LD1 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SGCZQ96LD1 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SGCZQ96LD1 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SGCZQ96LD1 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SGCZQ96LD1 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCZQ96LD1 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCZQ96LD1 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCZQ96LD1 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCZQ96LD1 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCZQ96LD1 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCZQ96LD1 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCZQ96LD1 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCZQ96LD1 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCZQ96LD1 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCZQ96LD1 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCZQ96LD1 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCZQ96LD1 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCZQ96LD1 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCZQ96LD1 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCZQ96LD1 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCZQ96LD1 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCZQ96LD1 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCZQ96LD1 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCZQ96LD1 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCZQ96LD1 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCZQ96LD1 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCZQ96LD1 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCZQ96LD1 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCZQ96LD1 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCZQ96LD1 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCZQ96LD1 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCZQ96LD1 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCZQ96LD1 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCZQ96LD1 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCZQ96LD1 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCZQ96LD1 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCZQ96LD1 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCZQ96LD1 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCZQ96LD1 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCZQ96LD1 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCZQ96LD1 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCZQ96LD1 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCZQ96LD1 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCZQ96LD1 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCZQ96LD1 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCZQ96LD1 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCZQ96LD1 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCZQ96LD1 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCZQ96LD1 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCZQ96LD1 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCZQ96LD1 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCZQ96LD1 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCZQ96LD1 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCZQ96LD1 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCZQ96LD1 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCZQ96LD1 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCZQ96LD1 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCZQ96LD1 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCZQ96LD1 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCZQ96LD1 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
SGCZQ96LD1 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
SGCZQ96LD1 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
SGCZQ96LD1 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
SGCZQ96LD1 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
SGCZQ96LD1 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
SGCZQ96LD1 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SGCZQ96LD1 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SGCZQ96LD1 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SGCZQ96LD1 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SGCZQ96LD1 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SGCZQ96LD1 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SGCZQ96LD1 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SGCZQ96LD1 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SGCZQ96LD1 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SGCZQ96LD1 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SGCZQ96LD1 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SGCZQ96LD1 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SGCZQ96LD1 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SGCZQ96LD1 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SGCZQ96LD1 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SGCZQ96LD1 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SGCZQ96LD1 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SGCZQ96LD1 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SGCZQ96LD1 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SGCZQ96LD1 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
SGCZQ96LD1 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SGCZQ96LD1 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SGCZQ96LD1 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SGCZQ96LD1 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SGCZQ96LD1 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms