Protein–RNA interactions for Protein: Q93084

ATP2A3, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A3Q93084 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP2A3Q93084 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms