Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SEMA6DQ8NFY4 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
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