Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA56

TTC29, Tetratricopeptide repeat protein 29, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC29Q8NA56 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TTC29Q8NA56 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TTC29Q8NA56 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TTC29Q8NA56 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TTC29Q8NA56 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TTC29Q8NA56 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TTC29Q8NA56 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TTC29Q8NA56 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TTC29Q8NA56 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TTC29Q8NA56 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TTC29Q8NA56 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TTC29Q8NA56 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TTC29Q8NA56 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TTC29Q8NA56 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TTC29Q8NA56 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TTC29Q8NA56 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TTC29Q8NA56 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TTC29Q8NA56 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TTC29Q8NA56 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TTC29Q8NA56 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TTC29Q8NA56 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TTC29Q8NA56 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TTC29Q8NA56 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TTC29Q8NA56 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TTC29Q8NA56 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TTC29Q8NA56 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TTC29Q8NA56 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TTC29Q8NA56 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TTC29Q8NA56 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TTC29Q8NA56 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TTC29Q8NA56 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TTC29Q8NA56 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TTC29Q8NA56 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TTC29Q8NA56 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TTC29Q8NA56 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TTC29Q8NA56 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TTC29Q8NA56 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TTC29Q8NA56 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TTC29Q8NA56 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TTC29Q8NA56 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TTC29Q8NA56 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TTC29Q8NA56 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TTC29Q8NA56 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TTC29Q8NA56 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TTC29Q8NA56 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TTC29Q8NA56 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TTC29Q8NA56 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TTC29Q8NA56 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TTC29Q8NA56 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TTC29Q8NA56 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TTC29Q8NA56 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TTC29Q8NA56 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TTC29Q8NA56 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TTC29Q8NA56 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TTC29Q8NA56 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TTC29Q8NA56 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TTC29Q8NA56 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TTC29Q8NA56 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TTC29Q8NA56 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TTC29Q8NA56 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TTC29Q8NA56 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TTC29Q8NA56 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TTC29Q8NA56 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TTC29Q8NA56 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TTC29Q8NA56 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TTC29Q8NA56 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TTC29Q8NA56 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TTC29Q8NA56 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TTC29Q8NA56 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TTC29Q8NA56 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TTC29Q8NA56 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TTC29Q8NA56 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TTC29Q8NA56 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TTC29Q8NA56 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TTC29Q8NA56 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TTC29Q8NA56 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TTC29Q8NA56 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TTC29Q8NA56 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TTC29Q8NA56 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TTC29Q8NA56 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TTC29Q8NA56 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TTC29Q8NA56 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TTC29Q8NA56 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TTC29Q8NA56 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TTC29Q8NA56 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TTC29Q8NA56 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TTC29Q8NA56 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TTC29Q8NA56 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TTC29Q8NA56 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TTC29Q8NA56 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TTC29Q8NA56 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TTC29Q8NA56 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TTC29Q8NA56 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TTC29Q8NA56 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TTC29Q8NA56 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TTC29Q8NA56 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TTC29Q8NA56 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TTC29Q8NA56 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TTC29Q8NA56 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TTC29Q8NA56 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms