Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAPPC6BQ86SZ2 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms