Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZR52

ZNF493, Zinc finger protein 493, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF493Q6ZR52 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
ZNF493Q6ZR52 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ZNF493Q6ZR52 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
ZNF493Q6ZR52 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ZNF493Q6ZR52 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ZNF493Q6ZR52 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ZNF493Q6ZR52 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ZNF493Q6ZR52 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ZNF493Q6ZR52 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ZNF493Q6ZR52 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ZNF493Q6ZR52 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ZNF493Q6ZR52 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ZNF493Q6ZR52 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ZNF493Q6ZR52 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ZNF493Q6ZR52 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ZNF493Q6ZR52 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ZNF493Q6ZR52 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ZNF493Q6ZR52 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
ZNF493Q6ZR52 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ZNF493Q6ZR52 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ZNF493Q6ZR52 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
ZNF493Q6ZR52 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
ZNF493Q6ZR52 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
ZNF493Q6ZR52 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
ZNF493Q6ZR52 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
ZNF493Q6ZR52 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
ZNF493Q6ZR52 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
ZNF493Q6ZR52 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
ZNF493Q6ZR52 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
ZNF493Q6ZR52 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
ZNF493Q6ZR52 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
ZNF493Q6ZR52 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
ZNF493Q6ZR52 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
ZNF493Q6ZR52 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
ZNF493Q6ZR52 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF493Q6ZR52 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF493Q6ZR52 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF493Q6ZR52 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF493Q6ZR52 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF493Q6ZR52 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF493Q6ZR52 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF493Q6ZR52 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF493Q6ZR52 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF493Q6ZR52 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF493Q6ZR52 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF493Q6ZR52 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF493Q6ZR52 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF493Q6ZR52 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF493Q6ZR52 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF493Q6ZR52 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF493Q6ZR52 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF493Q6ZR52 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF493Q6ZR52 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF493Q6ZR52 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF493Q6ZR52 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF493Q6ZR52 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF493Q6ZR52 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF493Q6ZR52 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF493Q6ZR52 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF493Q6ZR52 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF493Q6ZR52 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF493Q6ZR52 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF493Q6ZR52 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF493Q6ZR52 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF493Q6ZR52 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF493Q6ZR52 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF493Q6ZR52 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF493Q6ZR52 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF493Q6ZR52 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF493Q6ZR52 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF493Q6ZR52 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF493Q6ZR52 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF493Q6ZR52 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF493Q6ZR52 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF493Q6ZR52 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF493Q6ZR52 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF493Q6ZR52 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF493Q6ZR52 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF493Q6ZR52 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF493Q6ZR52 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF493Q6ZR52 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF493Q6ZR52 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF493Q6ZR52 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF493Q6ZR52 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF493Q6ZR52 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF493Q6ZR52 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF493Q6ZR52 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF493Q6ZR52 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF493Q6ZR52 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF493Q6ZR52 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ZNF493Q6ZR52 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ZNF493Q6ZR52 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ZNF493Q6ZR52 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ZNF493Q6ZR52 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
ZNF493Q6ZR52 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ZNF493Q6ZR52 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ZNF493Q6ZR52 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ZNF493Q6ZR52 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ZNF493Q6ZR52 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ZNF493Q6ZR52 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms