Protein–RNA interactions for Protein: Q6PJW8

CNST, Consortin, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNSTQ6PJW8 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNSTQ6PJW8 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNSTQ6PJW8 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNSTQ6PJW8 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNSTQ6PJW8 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNSTQ6PJW8 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNSTQ6PJW8 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNSTQ6PJW8 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNSTQ6PJW8 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNSTQ6PJW8 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNSTQ6PJW8 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNSTQ6PJW8 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CNSTQ6PJW8 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNSTQ6PJW8 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNSTQ6PJW8 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNSTQ6PJW8 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNSTQ6PJW8 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNSTQ6PJW8 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNSTQ6PJW8 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNSTQ6PJW8 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNSTQ6PJW8 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNSTQ6PJW8 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNSTQ6PJW8 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNSTQ6PJW8 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNSTQ6PJW8 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNSTQ6PJW8 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNSTQ6PJW8 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNSTQ6PJW8 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNSTQ6PJW8 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNSTQ6PJW8 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNSTQ6PJW8 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNSTQ6PJW8 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNSTQ6PJW8 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNSTQ6PJW8 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNSTQ6PJW8 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNSTQ6PJW8 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNSTQ6PJW8 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNSTQ6PJW8 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNSTQ6PJW8 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNSTQ6PJW8 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNSTQ6PJW8 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNSTQ6PJW8 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNSTQ6PJW8 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNSTQ6PJW8 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNSTQ6PJW8 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNSTQ6PJW8 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNSTQ6PJW8 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNSTQ6PJW8 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CNSTQ6PJW8 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CNSTQ6PJW8 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CNSTQ6PJW8 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNSTQ6PJW8 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CNSTQ6PJW8 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNSTQ6PJW8 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNSTQ6PJW8 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNSTQ6PJW8 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CNSTQ6PJW8 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNSTQ6PJW8 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNSTQ6PJW8 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNSTQ6PJW8 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNSTQ6PJW8 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNSTQ6PJW8 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNSTQ6PJW8 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNSTQ6PJW8 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNSTQ6PJW8 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNSTQ6PJW8 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNSTQ6PJW8 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNSTQ6PJW8 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNSTQ6PJW8 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNSTQ6PJW8 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNSTQ6PJW8 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNSTQ6PJW8 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNSTQ6PJW8 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNSTQ6PJW8 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNSTQ6PJW8 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNSTQ6PJW8 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNSTQ6PJW8 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNSTQ6PJW8 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNSTQ6PJW8 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNSTQ6PJW8 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNSTQ6PJW8 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNSTQ6PJW8 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNSTQ6PJW8 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNSTQ6PJW8 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNSTQ6PJW8 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNSTQ6PJW8 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNSTQ6PJW8 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNSTQ6PJW8 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNSTQ6PJW8 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNSTQ6PJW8 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNSTQ6PJW8 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNSTQ6PJW8 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNSTQ6PJW8 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNSTQ6PJW8 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNSTQ6PJW8 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CNSTQ6PJW8 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNSTQ6PJW8 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNSTQ6PJW8 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNSTQ6PJW8 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNSTQ6PJW8 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms