Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD40Q6AI12 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms