Protein–RNA interactions for Protein: Q674R7

ATG9B, Autophagy-related protein 9B, humanhuman

Predictions only

Length 924 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9BQ674R7 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATG9BQ674R7 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATG9BQ674R7 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATG9BQ674R7 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATG9BQ674R7 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATG9BQ674R7 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATG9BQ674R7 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATG9BQ674R7 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATG9BQ674R7 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATG9BQ674R7 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATG9BQ674R7 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATG9BQ674R7 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ATG9BQ674R7 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
ATG9BQ674R7 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ATG9BQ674R7 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ATG9BQ674R7 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
ATG9BQ674R7 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATG9BQ674R7 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATG9BQ674R7 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATG9BQ674R7 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATG9BQ674R7 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATG9BQ674R7 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATG9BQ674R7 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATG9BQ674R7 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATG9BQ674R7 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATG9BQ674R7 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATG9BQ674R7 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATG9BQ674R7 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATG9BQ674R7 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATG9BQ674R7 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATG9BQ674R7 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATG9BQ674R7 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATG9BQ674R7 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATG9BQ674R7 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATG9BQ674R7 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATG9BQ674R7 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATG9BQ674R7 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATG9BQ674R7 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATG9BQ674R7 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATG9BQ674R7 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATG9BQ674R7 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATG9BQ674R7 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATG9BQ674R7 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATG9BQ674R7 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATG9BQ674R7 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATG9BQ674R7 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATG9BQ674R7 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ATG9BQ674R7 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATG9BQ674R7 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ATG9BQ674R7 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATG9BQ674R7 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ATG9BQ674R7 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATG9BQ674R7 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATG9BQ674R7 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATG9BQ674R7 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATG9BQ674R7 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATG9BQ674R7 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATG9BQ674R7 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATG9BQ674R7 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATG9BQ674R7 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATG9BQ674R7 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATG9BQ674R7 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATG9BQ674R7 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATG9BQ674R7 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATG9BQ674R7 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATG9BQ674R7 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATG9BQ674R7 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATG9BQ674R7 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATG9BQ674R7 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATG9BQ674R7 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATG9BQ674R7 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATG9BQ674R7 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATG9BQ674R7 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATG9BQ674R7 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATG9BQ674R7 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATG9BQ674R7 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATG9BQ674R7 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATG9BQ674R7 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATG9BQ674R7 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATG9BQ674R7 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATG9BQ674R7 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATG9BQ674R7 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATG9BQ674R7 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATG9BQ674R7 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATG9BQ674R7 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATG9BQ674R7 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATG9BQ674R7 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATG9BQ674R7 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ATG9BQ674R7 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATG9BQ674R7 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATG9BQ674R7 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ATG9BQ674R7 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ATG9BQ674R7 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATG9BQ674R7 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATG9BQ674R7 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATG9BQ674R7 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATG9BQ674R7 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATG9BQ674R7 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATG9BQ674R7 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATG9BQ674R7 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.3 ms