Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCID2Q5JVF3 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PCID2Q5JVF3 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PCID2Q5JVF3 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PCID2Q5JVF3 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PCID2Q5JVF3 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PCID2Q5JVF3 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PCID2Q5JVF3 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PCID2Q5JVF3 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PCID2Q5JVF3 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PCID2Q5JVF3 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PCID2Q5JVF3 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCID2Q5JVF3 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCID2Q5JVF3 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCID2Q5JVF3 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCID2Q5JVF3 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCID2Q5JVF3 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCID2Q5JVF3 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCID2Q5JVF3 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCID2Q5JVF3 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCID2Q5JVF3 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCID2Q5JVF3 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCID2Q5JVF3 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCID2Q5JVF3 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCID2Q5JVF3 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCID2Q5JVF3 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms