Protein–RNA interactions for Protein: Q59GN2

RPL39P5, Putative 60S ribosomal protein L39-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P5Q59GN2 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RPL39P5Q59GN2 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
RPL39P5Q59GN2 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RPL39P5Q59GN2 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RPL39P5Q59GN2 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RPL39P5Q59GN2 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RPL39P5Q59GN2 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RPL39P5Q59GN2 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RPL39P5Q59GN2 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RPL39P5Q59GN2 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RPL39P5Q59GN2 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RPL39P5Q59GN2 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
RPL39P5Q59GN2 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RPL39P5Q59GN2 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RPL39P5Q59GN2 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
RPL39P5Q59GN2 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
RPL39P5Q59GN2 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RPL39P5Q59GN2 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
RPL39P5Q59GN2 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RPL39P5Q59GN2 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
RPL39P5Q59GN2 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RPL39P5Q59GN2 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RPL39P5Q59GN2 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RPL39P5Q59GN2 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
RPL39P5Q59GN2 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RPL39P5Q59GN2 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RPL39P5Q59GN2 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RPL39P5Q59GN2 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RPL39P5Q59GN2 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
RPL39P5Q59GN2 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RPL39P5Q59GN2 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
RPL39P5Q59GN2 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
RPL39P5Q59GN2 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
RPL39P5Q59GN2 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RPL39P5Q59GN2 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RPL39P5Q59GN2 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RPL39P5Q59GN2 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RPL39P5Q59GN2 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
RPL39P5Q59GN2 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
RPL39P5Q59GN2 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
RPL39P5Q59GN2 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RPL39P5Q59GN2 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
RPL39P5Q59GN2 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
RPL39P5Q59GN2 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
RPL39P5Q59GN2 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC12.43□□□□□ -0.42
RPL39P5Q59GN2 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
RPL39P5Q59GN2 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
RPL39P5Q59GN2 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC12.43□□□□□ -0.42
RPL39P5Q59GN2 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RPL39P5Q59GN2 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
RPL39P5Q59GN2 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
RPL39P5Q59GN2 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
RPL39P5Q59GN2 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RPL39P5Q59GN2 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RPL39P5Q59GN2 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
RPL39P5Q59GN2 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RPL39P5Q59GN2 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
RPL39P5Q59GN2 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
RPL39P5Q59GN2 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
RPL39P5Q59GN2 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
RPL39P5Q59GN2 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RPL39P5Q59GN2 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
RPL39P5Q59GN2 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
RPL39P5Q59GN2 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RPL39P5Q59GN2 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RPL39P5Q59GN2 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
RPL39P5Q59GN2 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RPL39P5Q59GN2 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RPL39P5Q59GN2 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RPL39P5Q59GN2 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RPL39P5Q59GN2 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RPL39P5Q59GN2 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RPL39P5Q59GN2 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
RPL39P5Q59GN2 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
RPL39P5Q59GN2 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
RPL39P5Q59GN2 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
RPL39P5Q59GN2 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
RPL39P5Q59GN2 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
RPL39P5Q59GN2 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
RPL39P5Q59GN2 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
RPL39P5Q59GN2 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
RPL39P5Q59GN2 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
RPL39P5Q59GN2 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
RPL39P5Q59GN2 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
RPL39P5Q59GN2 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
RPL39P5Q59GN2 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
RPL39P5Q59GN2 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
RPL39P5Q59GN2 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
RPL39P5Q59GN2 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
RPL39P5Q59GN2 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
RPL39P5Q59GN2 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
RPL39P5Q59GN2 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
RPL39P5Q59GN2 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
RPL39P5Q59GN2 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
RPL39P5Q59GN2 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
RPL39P5Q59GN2 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
RPL39P5Q59GN2 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
RPL39P5Q59GN2 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
RPL39P5Q59GN2 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
RPL39P5Q59GN2 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 613.6 ms