Protein–RNA interactions for Protein: Q562R1

ACTBL2, Beta-actin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBL2Q562R1 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ACTBL2Q562R1 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ACTBL2Q562R1 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ACTBL2Q562R1 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ACTBL2Q562R1 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ACTBL2Q562R1 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ACTBL2Q562R1 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ACTBL2Q562R1 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ACTBL2Q562R1 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ACTBL2Q562R1 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ACTBL2Q562R1 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ACTBL2Q562R1 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ACTBL2Q562R1 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ACTBL2Q562R1 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ACTBL2Q562R1 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ACTBL2Q562R1 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ACTBL2Q562R1 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ACTBL2Q562R1 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ACTBL2Q562R1 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ACTBL2Q562R1 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ACTBL2Q562R1 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ACTBL2Q562R1 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ACTBL2Q562R1 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ACTBL2Q562R1 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ACTBL2Q562R1 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ACTBL2Q562R1 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ACTBL2Q562R1 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ACTBL2Q562R1 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ACTBL2Q562R1 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ACTBL2Q562R1 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ACTBL2Q562R1 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ACTBL2Q562R1 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
ACTBL2Q562R1 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ACTBL2Q562R1 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ACTBL2Q562R1 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ACTBL2Q562R1 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ACTBL2Q562R1 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ACTBL2Q562R1 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ACTBL2Q562R1 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ACTBL2Q562R1 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ACTBL2Q562R1 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ACTBL2Q562R1 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ACTBL2Q562R1 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ACTBL2Q562R1 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ACTBL2Q562R1 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ACTBL2Q562R1 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ACTBL2Q562R1 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ACTBL2Q562R1 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ACTBL2Q562R1 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ACTBL2Q562R1 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ACTBL2Q562R1 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ACTBL2Q562R1 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ACTBL2Q562R1 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ACTBL2Q562R1 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ACTBL2Q562R1 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ACTBL2Q562R1 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ACTBL2Q562R1 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ACTBL2Q562R1 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ACTBL2Q562R1 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ACTBL2Q562R1 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ACTBL2Q562R1 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ACTBL2Q562R1 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ACTBL2Q562R1 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ACTBL2Q562R1 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ACTBL2Q562R1 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ACTBL2Q562R1 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ACTBL2Q562R1 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ACTBL2Q562R1 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ACTBL2Q562R1 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ACTBL2Q562R1 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ACTBL2Q562R1 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ACTBL2Q562R1 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ACTBL2Q562R1 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ACTBL2Q562R1 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ACTBL2Q562R1 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ACTBL2Q562R1 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ACTBL2Q562R1 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ACTBL2Q562R1 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ACTBL2Q562R1 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ACTBL2Q562R1 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ACTBL2Q562R1 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ACTBL2Q562R1 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ACTBL2Q562R1 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ACTBL2Q562R1 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ACTBL2Q562R1 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ACTBL2Q562R1 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ACTBL2Q562R1 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ACTBL2Q562R1 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ACTBL2Q562R1 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ACTBL2Q562R1 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ACTBL2Q562R1 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ACTBL2Q562R1 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ACTBL2Q562R1 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ACTBL2Q562R1 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ACTBL2Q562R1 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ACTBL2Q562R1 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ACTBL2Q562R1 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ACTBL2Q562R1 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ACTBL2Q562R1 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ACTBL2Q562R1 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms