Protein–RNA interactions for Protein: Q4VXA5

KHDC1, KH homology domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC1Q4VXA5 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KHDC1Q4VXA5 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms