Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPB7

AP5B1, AP-5 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP5B1Q2VPB7 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms