Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms