Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2I3

FAM83E, Protein FAM83E, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM83EQ2M2I3 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.02■□□□□ -0
FAM83EQ2M2I3 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
FAM83EQ2M2I3 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FAM83EQ2M2I3 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
FAM83EQ2M2I3 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FAM83EQ2M2I3 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FAM83EQ2M2I3 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FAM83EQ2M2I3 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
FAM83EQ2M2I3 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FAM83EQ2M2I3 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
FAM83EQ2M2I3 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FAM83EQ2M2I3 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FAM83EQ2M2I3 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FAM83EQ2M2I3 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FAM83EQ2M2I3 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
FAM83EQ2M2I3 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
FAM83EQ2M2I3 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FAM83EQ2M2I3 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
FAM83EQ2M2I3 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FAM83EQ2M2I3 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FAM83EQ2M2I3 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FAM83EQ2M2I3 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FAM83EQ2M2I3 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
FAM83EQ2M2I3 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.02■□□□□ -0
FAM83EQ2M2I3 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
FAM83EQ2M2I3 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
FAM83EQ2M2I3 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
FAM83EQ2M2I3 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.02■□□□□ -0
FAM83EQ2M2I3 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
FAM83EQ2M2I3 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
FAM83EQ2M2I3 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
FAM83EQ2M2I3 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.02■□□□□ -0
FAM83EQ2M2I3 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
FAM83EQ2M2I3 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
FAM83EQ2M2I3 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
FAM83EQ2M2I3 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
FAM83EQ2M2I3 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
FAM83EQ2M2I3 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
FAM83EQ2M2I3 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
FAM83EQ2M2I3 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
FAM83EQ2M2I3 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
FAM83EQ2M2I3 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
FAM83EQ2M2I3 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
FAM83EQ2M2I3 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
FAM83EQ2M2I3 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM83EQ2M2I3 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM83EQ2M2I3 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM83EQ2M2I3 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM83EQ2M2I3 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM83EQ2M2I3 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM83EQ2M2I3 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM83EQ2M2I3 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM83EQ2M2I3 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM83EQ2M2I3 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM83EQ2M2I3 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM83EQ2M2I3 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM83EQ2M2I3 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM83EQ2M2I3 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM83EQ2M2I3 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM83EQ2M2I3 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM83EQ2M2I3 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM83EQ2M2I3 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM83EQ2M2I3 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM83EQ2M2I3 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM83EQ2M2I3 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM83EQ2M2I3 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM83EQ2M2I3 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM83EQ2M2I3 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM83EQ2M2I3 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM83EQ2M2I3 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM83EQ2M2I3 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM83EQ2M2I3 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM83EQ2M2I3 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM83EQ2M2I3 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM83EQ2M2I3 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM83EQ2M2I3 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15□□□□□ -0.01
FAM83EQ2M2I3 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FAM83EQ2M2I3 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FAM83EQ2M2I3 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FAM83EQ2M2I3 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
FAM83EQ2M2I3 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FAM83EQ2M2I3 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FAM83EQ2M2I3 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
FAM83EQ2M2I3 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
FAM83EQ2M2I3 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FAM83EQ2M2I3 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FAM83EQ2M2I3 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15□□□□□ -0.01
FAM83EQ2M2I3 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
FAM83EQ2M2I3 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
FAM83EQ2M2I3 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
FAM83EQ2M2I3 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
FAM83EQ2M2I3 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FAM83EQ2M2I3 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FAM83EQ2M2I3 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FAM83EQ2M2I3 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FAM83EQ2M2I3 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
FAM83EQ2M2I3 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
FAM83EQ2M2I3 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FAM83EQ2M2I3 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FAM83EQ2M2I3 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms